Ο στόχος του Ezra and Nehemiah είναι να είσαι ο παίκτης με τους περισσότερους πόντους νίκης στο τέλος του παιχνιδιού. Πόντοι κερδίζονται κυρίως με την κατασκευή του ναού, την ανοικοδόμηση των τειχών και των πυλών της πόλης, και με τη διδασκαλία του Τορά στους εξόριστους που επέστρεψαν. Οι παίκτες μπορούν επίσης να διαλέξουν να αναπτύξουν τη γη τους, να ταξιδέψουν σε οικισμούς έξω από τα τείχη της πόλης ή να κρατήσουν τη φωτιά του βωμού αναμμένη μέρα και νύχτα. Οι προφήτες Haggai και Zechariah θα κάνουν το καθήκον τους για να κρατήσουν τους ανθρώπους συγκεντρωμένους σε αυτό που είναι πιο σημαντικό.

Σε τρείς εβδομάδες (γύρους), οι παίκτες θα χρησιμοποιήσουν τα φύλλα του χεριού τους, τους εργάτες, και τους πόρους τους για να βοηθήσουν στην ανοικοδόμηση της μεγάλης πόλης της Ιερουσαλήμ. Μετά από έξι ημέρες εργασίας έρχεται η ημέρα του Σαββάτου όπου οι παίκτες θα χρειαστούν φαγητό και θα αναλογιστούν την εργασία της εβδομάδας. Το παιχνίδι τελειώνει μετά την ολοκλήρωση του τρίτου Σαββάτου.